Небольшая прелюдия...
Начну с того что этот скрипт не является примером или
эталоном правильного программирования. Непонятные
претензии и обвинения неуместны. Всё добровольно
и абсолютно бесплатно. Ненравится?! Ненужно?!
Закройте тему и забудте что видели.

Адекватная критика, советы по улучшению и любая помощь только приветствуется

На тебе критику.
Первая же тупость убрать файл инекса в system/core.php
Вторая тупость в каждом файле прописывать:
ob_start ();
include_once 'inc/cfg.inc.php';
include 'inc/functions/func_list.php';
В третьих все по скрипту раскидано, сразу понимаешь что логика отсутствует.
Ну и код конечно бредовый

#2, пример: http://effectblog.pp.ru
#3, почему это файл индекса в system/core.php тупость?!
Второе тоже не обосновано!
Третье, логика присутствует, не каждый её поймёт

Автор ещё и категории сделай

коп стоит?