Дело не столько в панели сколько в системе хостинга.
например вот так /usr/bin/php -q /var/www/login/data/www/site.net/cron.php?do=1
Полный путь можно узнать в $_SERVER['DOCUMENT_ROOT']
Проси поддержку...

/usr/bin/wget http://site.net/cron.php?do=1

Сам вчера с суппортом полдня общался на эту тему.

/usr/bin/wget http://site.net/cron.php?do=1
при таком запросе все норм, но при каждом выполнении создается в корне файл cron.php?do=1 внутри которого html результат страницы... как сделать, что бы этот файл не создавался?

хех, команда wget как-бы скачивает контент по указанному url и, соответственно, сохраняет его. Чем php /path/to/file не устраивает?
добавлено спустя 33 секунды:
Fantom, у тебя, кстати, тоже должно быть такое. А тех поддержке по балде постучи .